Месторождение расположено в северных предгорьях Туркестанского хребта. По южной окраине месторождения протекает р. Исфара, являющаяся основным и единственным постоянно действующим водотоком района. Среднегодовой расход ее 16,4 м3/сек, при колебаниях от 2,6 до 29,8 м3/сек.
Рельеф района всхолмленный с абсолютными отметками от 1015 до 1270 м. Относительные превышения достигают 100—150 м. Климат континентальный, со значительными колебаниями температуры (от +1 до -24°). Среднегодовая температура составляет +13°. Осадков выпадает мало — 150—200 мм в год, древесная растительность отсутствует. Травяной покров, развитый на небольшой площади, быстро выгорает.
Площади Шурабского месторождения и населенные пункты связаны между собой густой сетью грунтовых дорог, пригодных к эксплуатации круглый год.
В административном отношении восточные площади Шурабского месторождения принадлежат Исфаринскому району Таджикистана, западные — Ляйлякскому району Киргизии.