Национальная академия наук Киргизской Республики (кирг. Кыргыз Республикасынын Улуттук Илимдер Академиясы) — высшее научное учреждение Киргизии.
5 января 1943 года было принято постановление СНК СССР о создании Киргизского филиала Академии наук СССР (Кирг. фил. АН СССР).
Филиал возглавил академик К. И. Скрябин.
20 декабря 1954 года в городе Фрунзе, на базе Киргизского филиала АН СССР, была образована Академия наук Киргизской ССР (АН Кирг. ССР). Академию возглавил Иса Коноевич Ахунбаев.
В развитии науки большую роль сыграли научные станции академии:
К концу 1960-х годов членами Академии были 1 почётный академик, 28 действительных членов и 20 членов-корреспондентов. В системе Академии работали три отделения и 13 нии: Институт физики и математики, Иститут физики и механики горных пород, Институт автоматики, Институт геологии, Институт неорганической и физической химии, Институт органической химии, Институт биохимии и физиологии, Институт биологии, Институт физиологии и экспериментальной патологии высокогорья, Институт истории, Институт философии и права, Институт языка и литературы, Институт экономики; а также отделы географии, общей тюркологии и дунгановедения, биологическая станция, ботанический сад, научная библиотека. С 1959 года издавались «Известия», выходили в свет научные труды по различным отраслям знания.
В 1975 году за заслуги в развитии советской науки АН Киргизской ССР была награждена орденом Дружбы народов.
В 1993 году Правительство Республики Киргизия приняло постановление (№ 386 от 18 августа 1993 г.) о преобразовании Академии наук Киргизской Pecпублики в Национальную академию наук Киргизской Республики (НАН КР) и придании ей статуса высшего государственного научного учреждения.
В 2002 году был принят Закон о Национальной академии наук Киргизской Республики.
В 2004 году в республике был отмечен 50-летний юбилей НАН КР.
В 2010 году были проведены дополнительные выборы в НАН КР — избраны 5 действительных членов (академиков) и 11 членов-корреспондентов.
В 2013 году организованы выборы президента НАН КР, избран новый состав Президиума НАН КР.
В 2014 году учреждён «Союз учёных НАН Киргизской Республики». Власти Киргизии обсуждали вопрос о ликвидации Академии с передачей её функций научным организациям, министерствам и вузам. Ограничились значительным сокращением штата и ликвидацией ряда подразделений. К ноябрю 2016 года численность сотрудников Академии уменьшилась с 4000 человек до 1940 человек. Были упразднены 9 из 25 научно-исследовательских институтов. Сократили и административный аппарат — были ликвидированы должности четырёх вице-президентов Академии.
В составе НАН КР:
Высшим органом управления НАН КР является «Общее собрание НАН КР», текущие вопросы решает Президиум НАН КР.
В академии 4 отделения: ФТМиГГН, ХТМБиСХН, ГиЭН и Южное отделение, и несколько подразделений:
Первыми действительными членами Академии наук Киргизской ССР стали: