VIII сезон Второй лиги первенства России по футболу состоялся в 1999 году в период с 5 апреля по 6 ноября.
В сезоне 1999 года во втором дивизионе были заявлены 108 команд. В межсезонье некоторые из них сменили свои названия:
По ходу сезона «Торпедо» (Арзамас) сменило название на «Арзамас».
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Лучшие бомбардиры:
Команды, занявшие первые места в своих зонах, были разбиты на пары. Победитель по сумме двух матчей выходил в Первый дивизион. Повышения в классе добились «Спартак-Чукотка» (Москва), «Лада-Тольятти-ВАЗ» (Тольятти) и «Носта» (Новотроицк).