22 страны подали заявки на участие в Кубке африканских наций 1968 года, претендуя на 8 мест в финальном турнире. Гана (действующий чемпион) и Эфиопия (хозяйка турнира) получили путёвки автоматически, а остальные 20 стран были разбиты на 6 отборочных групп, в каждой из которых разыгрывалась одна путёвка. Две отборочные группы состояли из четырёх команд каждая, в них был сыгран турнир на выбывание. В остальных группах, состоявших из трёх команд каждая, был сыгран двухкруговой турнир.
Группа 1
Дополнительный матч
Сенегал получил путёвку в финальный турнир.
Группа 2
Алжир получил путёвку в финальный турнир.
Группа 3
Берег Слоновой Кости получил путёвку в финальный турнир.
Группа 4
Первый этап
ОАР вышла во второй этап.
Уганда вышла во второй этап.
Второй этап
Уганда получила путёвку в финальный турнир.
Группа 5
Республика Конго получила путёвку в финальный турнир.
Группа 6
Первый этап
Танзания вышла во второй этап.
Дополнительный матч
Конго-Киншаса вышло во второй этап.
Второй этап
Танзания отказалась от дальнейшего участия в турнире,
Конго-Киншаса автоматически получило путёвку в финальный турнир.